Em 2000, foi anunciado a saída de Luiz Henrique Júnior, ex-assessor do então secretário de Estado Luiz Henrique Magalhães.

Em 11 1️⃣ de janeiro do mesmo ano, no entanto, João Mendes foi anunciado como novo ministro da Defesa Nacional, substituindo Eduardo Cunha 1️⃣ Lima, o ministro responsável para o caso.

Já o titular da função durante o período do ministério seria Rodrigo Janot.

Em 17 1️⃣ de janeiro de 2000, o presidente Itamar Franco foi demitido do Ministério da Defesa Nacional, por um decreto presidencial, e 1️⃣ substituído pelo marechal Álvaro Costa.

Ele também foi substituído por