Em 1997, a direção do Botafogo anunciou o retorno à gestão de Paulo César Caju como presidente.

Já em 2001, a 9️⃣ direção do Botafogo conquistou um dos títulos do Campeonato Brasileiro.

Em 2002, o clube revelou o zagueiro Paulo Sérgio, jogador mais 9️⃣ caro da história do clube, com passagens por times do América do Sul.

No ano de 2004, o Botafogo, do futebol 9️⃣ fluminense, conquistou o Torneio Rio-São Paulo, torneio continental disputado todos os anos.

A equipe venceu todos os jogos em casa, exceto 9️⃣ um,